LINUX./setup.sh

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captured-error.1.1.txt11rnamut.1.1overwritetruescp://geossdev.med.virginia.edu:22/home/sc2cg/outputs/rnamut.1.1sc2cgsunsaapt1406GHCNV.egfroverwritetruerns:/home/mrf4u/CNV.egfrCNV.erbb2overwritetruerns:/home/mrf4u/CNV.erbb2CNV.metoverwritetruerns:/home/mrf4u/CNV.metMUT.RDataoverwritetruerns:/home/mrf4u/MUT.RDataRNA.RDataoverwritetruerns:/home/mrf4u/RNA.RDataSENS.RDataoverwritetruerns:/home/mrf4u/SENS.RDataSource-coxen.Roverwritetruerns:/home/mrf4u/Source-coxen.RSource.Roverwritetruerns:/home/mrf4u/Source.Rcnvvoverwritetruerns:/home/mrf4u/cnvvgskminimal.txtoverwritetruerns:/home/mrf4u/gskminimal.txtinstallPackages.Roverwritetruerns:/home/mrf4u/installPackages.Rmcdermottminimal.txtoverwritetruerns:/home/mrf4u/mcdermottminimal.txtmuttoverwritetruerns:/home/mrf4u/muttresult.roverwritetruerns:/home/mrf4u/result.rrnaaoverwritetruerns:/home/mrf4u/rnaasen.res.X1overwritetruerns:/home/mrf4u/sen.res.X1sens-rna-mut-sim.Roverwritetruerns:/home/mrf4u/sens-rna-mut-sim.Rsenssoverwritetruerns:/home/mrf4u/senssrnamut.1.1overwritetruescp://blue.unix.virginia.edu:22/home/mrf4u/cho_outputs/rnamut.1.1mrf4uxJx4fvrgcaptured-output.1.1.txtoverwritetruescp://blue.unix.virginia.edu:22/home/mrf4u/cho_outputs/captured-output.1.1.txtmrf4uxJx4fvrgcaptured-error.1.1.txtoverwritetruescp://blue.unix.virginia.edu:22/home/mrf4u/cho_outputs/captured-error.1.1.txtmrf4uxJx4fvrgsens-rna-mut-sim64.Roverwritetruerns:/home/mrf4u/sens-rna-mut-sim64.Rsens-rna-mut-sim32.Roverwritetruerns:/home/mrf4u/sens-rna-mut-sim32.Rsetup.shoverwritetruerns:/home/mrf4u/setup.sh